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PJ|山梨醇脱氢酶基因MdSDH2启动子的变异影响转录因子MdABI3的结合并改变苹果果实中的果糖含量
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2021年12月9日,团队在《The Plant Journal》上发表了题为“Variation in the promoter of the sorbitol dehydrogenase gene MdSDH2 affects binding of the transcription factor MdABI3 and alters fructose content in apple fruit”的研究论文

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该研究以‘蜜脆’和‘秦冠’为杂交亲本,结合前期构建的高密度SNP遗传连锁图谱,对F1代杂交群体果实果糖含量性状进行QTL定位,并在‘蜜脆’遗传连锁图谱LG 01上定位到了一个连续两年稳定的主效QTL位点。通过基因组信息分析在该位点得到了315个候选基因,结合GO、KEGG分析、亲本果实发育期的果糖含量变化和RNA-seq分析,寻找到了目的基因MdSDH2。通过转化MdSDH2到苹果愈伤组织中并测定糖含量,确定了该基因能够催化山梨醇转化为果糖,从而调控果糖含量。

为探明亲本中MdSDH2表达差异的原因,通过分析亲本的编码区及启动子区序列,发现仅在‘蜜脆’启动子一种单倍型上的SNP包含在ABI3转录因子的结合位点中,该位点极有可能影响MdSDH2的转录调控。通过试验分析,最终确定了该SNP位点能够影响ABA信号途径中MdABI3转录因子对MdSDH2启动子的结合以及转录调控,从而影响MdSDH2表达和果糖含量。本研究不仅发现了果糖含量遗传调控的主效基因MdSDH2,发掘了一种可用于果糖含量分子辅助育种的潜在标记SNP(SDH2p-491 A/G),为ABA参与果糖含量调控提供理论依据,为苹果复杂性状育种和遗传分析提供新的见解。

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MdSDH2启动子中的SNP变异影响ABI3的转录调控及果糖含量的模型

论文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/tpj.15624



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